Efficient base editing in methylated regions with a human APOBEC3A-Cas9 fusion

doi:10.1038/nbt.4198

	Efficient base editing in methylated regions with a human APOBEC3A-Cas9 fusion
	Wang, Xiao1,2,3 ; Li, Jianan1,2,3 ; Wang, Ying 4; Yang, Bei5 ; Wei, Jia 4; Wu, Jing1 ; Wang, Ruixuan1 ; Huang, Xingxu1 ; Chen, Jia1 ; Yang, Li4
	2018-10
发表期刊	NATURE BIOTECHNOLOGY (IF:33.1[JCR-2023],56.9[5-Year])
ISSN	1087-0156
卷号	36 期号:10 页码:946-949
发表状态	已发表
DOI	10.1038/nbt.4198
摘要	Base editors (BEs) enable the generation of targeted single-nucleotide mutations, but currently used rat APOBEC1-based BEs are relatively inefficient in editing cytosines in highly methylated regions or in GpC contexts. By screening a variety of APOBEC and AID deaminases, we show that human APOBEC3A-conjugated BEs and versions we engineered to have narrower editing windows can mediate efficient C-to-T base editing in regions with high methylation levels and GpC dinucleotide content.
收录类别	SCI ; SCIE ; EI
资助项目	Shanghai Pujiang Program[16PJ1407000] ; Shanghai Pujiang Program[16PJ1407500]
WOS研究方向	Biotechnology & Applied Microbiology
WOS类目	Biotechnology & Applied Microbiology
WOS记录号	WOS:000447001600013
出版者	NATURE PUBLISHING GROUP
EI入藏号	20184305973711
EI主题词	Alkylation
EI分类号	Biology:461.9 ; Chemical Reactions:802.2
WOS关键词	CYTOSINE DEAMINATION ; DNA ; APOBEC
原始文献类型	Article
引用统计	正在获取...
文献类型	期刊论文
条目标识符	https://kms.shanghaitech.edu.cn/handle/2MSLDSTB/28117
专题	生命科学与技术学院_本科生生命科学与技术学院_PI研究组_陈佳组生命科学与技术学院_PI研究组_黄行许组免疫化学研究所_特聘教授组_抗体结构学实验室生命科学与技术学院_特聘教授组_杨力组生命科学与技术学院_硕士生生命科学与技术学院_博士生免疫化学研究所_PI研究组_杨贝组
共同第一作者	Li, Jianan; Wang, Ying; Yang, Bei; Wei, Jia
通讯作者	Huang, Xingxu; Chen, Jia; Yang, Li
作者单位	1.ShanghaiTech Univ, Sch Life Sci & Technol, Shanghai, Peoples R China 2.Chinese Acad Sci, Shanghai Inst Biochem & Cell Biol, Shanghai, Peoples R China 3.Univ Chinese Acad Sci, Beijing, Peoples R China 4.Univ Chinese Acad Sci, Chinese Acad Sci, Shanghai Inst Biol Sci,Shanghai Inst Nutr & Hlth, Key Lab Computat Biol,CAS MPG Partner Inst Comput, Shanghai, Peoples R China 5.ShanghaiTech Univ, Shanghai Inst Adv Immunochem Studies, Shanghai, Peoples R China
第一作者单位	生命科学与技术学院
通讯作者单位	生命科学与技术学院
第一作者的第一单位	生命科学与技术学院
推荐引用方式 GB/T 7714	Wang, Xiao,Li, Jianan,Wang, Ying,et al. Efficient base editing in methylated regions with a human APOBEC3A-Cas9 fusion[J]. NATURE BIOTECHNOLOGY,2018,36(10):946-949.
APA	Wang, Xiao.,Li, Jianan.,Wang, Ying.,Yang, Bei.,Wei, Jia.,...&Yang, Li.(2018).Efficient base editing in methylated regions with a human APOBEC3A-Cas9 fusion.NATURE BIOTECHNOLOGY,36(10),946-949.
MLA	Wang, Xiao,et al."Efficient base editing in methylated regions with a human APOBEC3A-Cas9 fusion".NATURE BIOTECHNOLOGY 36.10(2018):946-949.