一种简洁全面的拷贝数变异模式识别方法及其应用

	一种简洁全面的拷贝数变异模式识别方法及其应用
翻译题名	The invention discloses a concise and comprehensive copy number variation pattern recognition method and application thereof
申请号	CN202110834969.9
	2021-07-23
公开（公告）号	CN113571130A
公开日期	2021-10-29
摘要	本发明涉及一种简洁全面的拷贝数变异模式识别方法及其应用，属于生物医学技术领域。本发明通过将获得的肿瘤样本的绝对拷贝数信息进行分类；并依据每种拷贝数片段在泛癌数据中的实际分布情况，形成一个176列数据信息的矩阵；计算每个肿瘤样本的拷贝数变异特征模式；利用非负矩阵分解算法计算每个肿瘤的具体拷贝数变异特征模式；量化每个肿瘤中拷贝数变异特征模式的活性；依据拷贝数变异特征模式对肿瘤进行分型；依据拷贝数变异特征模式的活性对肿瘤病人进行预后预测。从而实现对肿瘤病人预后的精准预测。
翻译摘要	The invention relates to a simple and comprehensive copy number variation pattern recognition method and application thereof, and belongs to the technical field of biomedicine. The invention classifies the absolute copy number information of the tumor sample; Forming a matrix of 176 columns of data information according to the actual distribution of each copy number fragment in the pantothenic cancer data; Calculating the copy number variation characteristic pattern of each tumor sample; Calculating specific copy number variation characteristic pattern of each tumor by using non-negative matrix decomposition algorithm; Quantifying the activity of the copy number variation characteristic pattern in each tumor; Typing the tumor according to the copy number variation characteristic pattern; Prognosis prediction is performed on tumor patients based on the activity of the copy number variation characteristic pattern. Therefore, the accurate prediction of the prognosis of tumor patients is realized.
当前权利人	上海科技大学
专利代理人	翁若莹
代理机构	上海申汇专利代理有限公司 31001
专利申请人	上海科技大学
	刘雪松; 陶紫玉; 吴宸旭
公开国别	中国
公开国别简称	CN
IPC 分类号	G16B20//20; G16B40//00; C12Q1//6837; C12Q1//6869; C12Q1//6886
专利有效性	有效
专利类型	发明申请
专利类型字典	1
当前法律状态	授权
授权公告日	2023-08-18
授权公开（公告）号	CN113571130B
简单同族	CN113571130A
扩展同族	CN113571130A
INPADOC 同族	CN113571130A
文献类型	专利
条目标识符	https://kms.shanghaitech.edu.cn/handle/2MSLDSTB/128484
专题	生命科学与技术学院_博士生生命科学与技术学院_PI研究组_刘雪松组生命科学与技术学院_硕士生
作者单位	上海科技大学
推荐引用方式 GB/T 7714	刘雪松, 陶紫玉, 吴宸旭. 一种简洁全面的拷贝数变异模式识别方法及其应用. CN202110834969.9[P]. 2021-07-23.