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实验室方向是从基因组DNA变异角度研究肿瘤发生以及演化的规律，寻找预测肿瘤临床表现的标志物，并设计针对性的治疗策略。

目前实验室的具体研究内容包括：1，从肿瘤基因组角度探讨免疫治疗临床实践中遇到的关键科学问题。如，开发新的肿瘤基因组标志物以高效区分免疫治疗有反应和不反应病人；研究肿瘤细胞免疫原性的分子遗传基础，进而设计提高肿瘤细胞免疫原性的新策略，从而把免疫治疗不反应病人变成有反应病人。2，研究肿瘤基因组DNA复杂变异的特征模式，背后驱动因素以及临床相关性。重点关注拷贝数变异（copy number alteration）、插入删除（small indel）的变异模式，与肿瘤临床尤其是免疫治疗的内在关系。3，利用生化细胞、小鼠模型研究肿瘤新靶标和机制，尤其关注新的非编码变异的功能与机制。实验室应用到的技术手段包括：肿瘤基因组生物信息学分析、生化细胞技术和小鼠模型。

本课题组在上科大已发表的工作围绕肿瘤免疫治疗的基因组标志物开展。首次报道特征性的基因组DNA变异模式（APOBEC变异模式）能作为肺癌免疫治疗效果预测的标志物；创新性地定量了肿瘤的免疫原性，并据此开发出一种比目前已知的免疫治疗标志物精确度和实用性均更为优异的标志物（肿瘤免疫原性指数，TIGS）；首次发现肿瘤免疫治疗标志物TMB（Tumor mutational burden，肿瘤突变负荷）的临床预测效果的性别差异等。上述工作扩展了对肿瘤免疫治疗组学标志物的认识，具有重要的临床应用前景，受到学术界的广泛关注与引用。据此也申报多项发明专利。