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Benchmarking copy number aberrations inference tools using single-cell multi-omics datasets
预印本
2024
作者:
Song, Minfang
;
Ma, Shuai
;
Yang, Zhenzhen
;
Xie, Bin
;
Guo, Tongkun
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浏览/下载:61/0
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提交时间:2024/10/14
scRNA-seq
copy number aberrations
copy number alterations
copy number variations
inference
DNA methylation profiles of ovarian cysts resemble ovarian tissues but not endometrial tissues
期刊论文
JOURNAL OF OVARIAN RESEARCH, 2024, 卷号: 17, 期号: 1
作者:
Zhang, Xiaohui
;
Zhao, Xiaojing
;
Wang, Jiapo
;
Zhang, Yifang
;
Chen, Jinhong
Adobe PDF(3480Kb)
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浏览/下载:94/5
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提交时间:2024/06/24
Ovarian endometriosis
DNA methylation
Tissue of origin
THEMIS is a substrate and allosteric activator of SHP1, playing dual roles during T cell development
期刊论文
NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY, 2024, 卷号: 31, 期号: 1
作者:
Zhang, Jiali
;
Jiang, Zhenzhou
;
Zhang, Xueyuan
;
Yang, Ziqun
;
Wang, Jinjiao
Adobe PDF(6453Kb)
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浏览/下载:545/2
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提交时间:2023/09/22
Themis
TCR signal
SHP1
BMP-ACVR1 Axis is Critical for Efficacy of PRC2 Inhibitors in B-Cell Lymphoma
期刊论文
ADVANCED SCIENCE, 2024, 卷号: 11, 期号: 12
作者:
Liu, Dongdong
;
Li, Zhen
;
Tan, Dongxia
;
An, Yang
;
Chu, Liping
Adobe PDF(14405Kb)
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浏览/下载:243/0
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提交时间:2024/02/02
Bone
Cell signaling
Cytology
Oncology
Proteins
Activin A receptor type 1
B cells
B-Cell Lymphoma
Bone morphogenetic proteins
Cancer therapeutics
Catalytic subunits
Germinal centers
Histone methyltransferases
Polycomb
Polycomb repressive complex 2 inhibitor
Structural basis of gRNA stabilization and mRNA recognition in trypanosomal RNA editing
期刊论文
SCIENCE, 2023, 卷号: 381, 期号: 6653
作者:
Liu, Shiheng
;
Wang, Hong
;
Li, Xiaorun
;
Zhang, Fan
;
Lee, Jane K. J.
Adobe PDF(3168Kb)
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浏览/下载:280/0
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提交时间:2023/08/28
Was Wuhan the early epicenter of the COVID-19 pandemic?-A critique
期刊论文
NATIONAL SCIENCE REVIEW, 2023, 卷号: 10, 期号: 4
作者:
Cao, Yanan
;
Chen, Lingling
;
Chen, Hua
;
Cun, Yupeng
;
Dai, Xiaofeng
Adobe PDF(175Kb)
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浏览/下载:399/61
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提交时间:2023/05/29
Point mutations of homologs as an adaptive solution to the gene loss
期刊论文
JOURNAL OF GENETICS AND GENOMES, 2023, 卷号: 50, 期号: 7
作者:
Ma, Guosheng
;
Zhao, Xiaojing
;
Shentu, Xinyi
;
Zhang, Liye
Adobe PDF(1727Kb)
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浏览/下载:198/3
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提交时间:2023/04/14
gene loss
ULP2
homologous gene
compensatory mutation
genome evolution
Hypothalamic warm-sensitive neurons require TRPC4 channel for detecting internal warmth and regulating body temperature in mice
期刊论文
NEURON;, 2023, 卷号: 111, 期号: 3, 页码: 387-404.e8
作者:
Zhou, Qian
;
Fu, Xin
;
Xu, Jianhui
;
Dong, Shiming
;
Liu, Changhao
Adobe PDF(7374Kb)
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浏览/下载:410/1
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提交时间:2023/03/24
internal sensor
preoptic area
thermoregulation
TRPC4
warm-sensitive neurons
Joint analysis of scATAC-seq datasets using epiConv
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 1
作者:
Lin, Li
;
Zhang, Liye
Adobe PDF(3676Kb)
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浏览/下载:577/186
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提交时间:2022/08/12
Cell culture
Batch effect
Cell proliferation
Biological signals
Chromosomes
Cell clustering
Depth profiling
High-throughput
Joint analysis
Multiple data sets
Multiple source
ScATAC-seq
Single cells
Technical improvement
Characterization of the evolution trajectory and immune profiling of new histologic patterns in lung adenocarcinoma
期刊论文
JOURNAL OF GENE MEDICINE, 2022
作者:
Song, Minfang
;
Xie, Huikang
;
Liu, Wei
;
Zhao, Mengmeng
;
Deng, Ziqing
Adobe PDF(45179Kb)
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浏览/下载:243/0
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提交时间:2022/11/08
cancer-associated fibroblasts
complex glands
evolutionary trajectory
lung cancer
Lung cancer
Complex glands
Evolutionary trajectory
Cancer-associated fibroblasts