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scICML: Information-Theoretic Co-Clustering-Based Multi-View Learning for the Integrative Analysis of Single-Cell Multi-Omics Data
期刊论文
IEEE/ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2024, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 200-207
作者:
Zeng, Pengcheng
;
Lin, Zhixiang
Adobe PDF(1032Kb)
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浏览/下载:282/42
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提交时间:2024/03/08
Clustering
multi-view learning
single-cell multi-omics integration
Bioinformatics
Cytology
Data integration
Gene expression
Information analysis
Information theory
Pattern matching
'omics'
Clusterings
Genes expression
Genomics
Multi-view learning
Mutual informations
Optimisations
Pattern-matching
Single cells
Single-cell multi-omic integration
Joint analysis of scATAC-seq datasets using epiConv
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 1
作者:
Lin, Li
;
Zhang, Liye
Adobe PDF(3676Kb)
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浏览/下载:757/220
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提交时间:2022/08/12
Cell culture
Batch effect
Cell proliferation
Biological signals
Chromosomes
Cell clustering
Depth profiling
High-throughput
Joint analysis
Multiple data sets
Multiple source
ScATAC-seq
Single cells
Technical improvement
Transcriptome analysis method based on differential distribution evaluation
期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022
作者:
Meng, Yiwei
;
Huang, Yanhong
;
Chang, Xiao
;
Liu, Xiaoping
;
Chen, Luonan
Adobe PDF(1613Kb)
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浏览/下载:331/0
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提交时间:2022/03/23
gene expression
differential distribution genes
cancer subtyping
single-cell clustering
disease early-warning signals
potential disease modules
High-Order Correlation Integration for Single-Cell or Bulk RNA-seq Data Analysis
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2019, 卷号: 10
作者:
Tang, Hui
;
Zeng, Tao
;
Chen, Luonan
Adobe PDF(4700Kb)
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浏览/下载:1473/479
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提交时间:2019/05/23
high-order
integration
clustering
single-cell
bulk data analysis
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