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本发明涉及一种肿瘤新抗原特征分析与免疫原性预测工具及其应用，属于生物信息学和肿瘤免疫治疗技术领域。本发明提供一种肿瘤新抗原特征分析与免疫原性预测方法，并应用该方法提供一种肿瘤新抗原多角度特征分析以及免疫原性预测的工具。工具从原始测序数据出发，识别出突变位点以及病人的HLA类型；预测突变多肽与HLAI以及HLAII的亲和力；突变肽相比野生肽与HLA亲和力差异；突变肽的转运效率；突变肽所在基因的表达水平等新抗原特征。该工具直接预测给定新抗原激活特异性CD8+T细胞的潜力。对肿瘤新抗原识别，肿瘤疫苗设计，肿瘤精准免疫靶点寻找开发均有重要价值。