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作者
陈铭安 [8]
虞杰 [2]
高盛华 [1]
文献类型
期刊论文 [5]
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发表日期
2024 [6]
2023 [2]
出处
bioRxiv [2]
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SurfDock is a surface-informed diffusion generative model for reliable and accurate protein-ligand complex prediction
期刊论文
NATURE METHODS, 2024
作者:
Cao, Duanhua
;
Chen, Mingan
;
Zhang, Runze
;
Wang, Zhaokun
;
Huang, Manlin
Adobe PDF(4291Kb)
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浏览/下载：308/72
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提交时间：2024/06/03
Generic protein-ligand interaction scoring by integrating physical prior knowledge and data augmentation modelling
期刊论文
NATURE MACHINE INTELLIGENCE, 2024, 卷号: 6, 期号: 6, 页码: 688-700
作者:
Cao, Duanhua
;
Chen, Geng
;
Jiang, Jiaxin
;
Yu, Jie
;
Zhang, Runze
Adobe PDF(3326Kb)
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浏览/下载：190/0
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提交时间：2024/06/17
Graph neural networks
Lead compounds
Proteins
Data augmentation
Data-driven methods
Docking methods
Graph neural networks
Heterogeneous graph
Prior-knowledge
Protein-ligand interactions
Robust methods
Standing problems
Training data
Fine-tuning large language models for chemical text mining
期刊论文
CHEMICAL SCIENCE, 2024, 卷号: 15, 期号: 27, 页码: 10600-10611
作者:
Zhang, Wei
;
Wang, Qinggong
;
Kong, Xiangtai
;
Xiong, Jiacheng
;
Ni, Shengkun
Adobe PDF(4746Kb)
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浏览/下载：198/1
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提交时间：2024/06/24
Computational linguistics
Data acquisition
Data mining
Extraction
Knowledge management
Nuclear magnetic resonance spectroscopy
Organometallics
Computational chemists
Entity recognition
Fine tuning
Labelings
Language model
Metalorganic frameworks (MOFs)
Mining tasks
Power
Scientific literature
Text-mining
PackDock: a Diffusion Based Side Chain Packing Model for Flexible Protein-Ligand Docking
预印本
2024
作者:
Zhang, Runze
;
Jiang, Xinyu
;
Cao, Duanhua
;
Yu, Jie
;
Chen, Mingan
Adobe PDF(2180Kb)
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浏览/下载：162/17
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提交时间：2024/06/03
Reducing overconfident errors in molecular property classification using Posterior Network
期刊论文
PATTERNS, 2024, 卷号: 5, 期号: 6
作者:
Fan, Zhehuan
;
Yu, Jie
;
Zhang, Xiang
;
Chen, Yijie
;
Sun, Shihui
Adobe PDF(2007Kb)
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浏览/下载：146/0
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提交时间：2024/06/07
Computational chemistry
Deep learning
Drug products
Artificial intelligence-aided drug design
Classification models
Drug Design
Drug development
Molecular properties
Property classification
QSAR
Trustworthy AI
Uncertainty estimation
Uncertainty quantifications
The emergence of machine learning force fields in drug design
期刊论文
MEDICINAL RESEARCH REVIEWS, 2024
作者:
Mingan Chen
;
Xinyu Jiang
;
Lehan Zhang
;
Xiaoxu Chen
;
Yiming Wen
Adobe PDF(2672Kb)
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浏览/下载：167/8
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提交时间：2024/09/23
Fine-tuning ChatGPT Achieves State-of-the-Art Performance for Chemical Text Mining
预印本
2023
作者:
Zhang, Wei
;
Wang, Qinggong
;
Kong, Xiangtai
;
Xiong, Jiacheng
;
Ni, Shengkun
Adobe PDF(7104Kb)
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浏览/下载：258/63
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提交时间：2024/05/15
Chemical Text Mining
Large Language Models
ChatGPT
Fine-tune
Few-data
Knowledge Extraction
Cheminformatics
synthesis
chemical synthesis
llama
language model
MOF
NMR
reaction role
chemical procedure
paragraph
LLMs
structured data
EquiScore: A generic protein-ligand interaction scoring method integrating physical prior knowledge with data augmentation modeling
预印本
2023
作者:
Cao, Duanhua
;
Chen, Geng
;
Jiang, Jiaxin
;
Yu, Jie
;
Zhang, Runze
Adobe PDF(3542Kb)
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浏览/下载：195/0
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提交时间：2024/01/09
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