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本申请涉及液滴微流控的单细胞分析领域，特别涉及一种乳液中的可控细胞裂解方法。本申请提供一种液滴中细胞裂解的方法，包括以下步骤：1)液滴单细胞包裹：将单细胞在第一油相存在的条件下通过微流控芯片包裹进液滴中，获得包含第一油相和液滴的第一混合物；2)细胞裂解：将第一混合物中的第一油相替换为含细胞裂解液的第二油相，孵育，实现细胞裂解。对于在液滴中实现细胞裂解而言，本申请用含有细胞裂解液的第二油相可以实现液滴在微流控芯片之外的地方实现细胞裂解，不仅操作难度低，且细胞裂解方法简单高效，能够实现低成本、高通量、可控的细胞裂解，适用性广泛。