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本发明涉及牙齿诊断技术领域，尤其涉及基于IOS图像和CBCT图像的牙周疾病精准定量评估方法，包括以下步骤：对口内扫描IOS图像进行图像分割，以获取每颗牙齿的IOS分割结果；对CBCT图像进行图像分割，以获取每颗牙齿的CBCT分割结果；将IOS分割结果和CBCT分割结果进行预处理和配准，以获得数据融合模型；根据数据融合模型获取牙龈轮廓和牙齿长轴, 根据牙龈轮廓获取牙龈轮廓点，牙龈轮廓点沿着牙齿长轴的方向在牙槽骨上得到牙槽骨轮廓并获取GBD距离；根据GBD距离评估牙周疾病。本发明根据分割IOS结果和CBCT结果得到数据融合模型，通过数据融合模型得到牙龈轮廓和牙齿长轴，沿着牙长轴方向测量牙龈轮廓和牙槽骨轮廓的GBD距离，以评估牙周疾病健康状况。