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本发明提供一种基于微型CRISPR Cas蛋白Cas12f1的碱基编辑器系统，该碱基编辑器系统至少包括：Cas12f1蛋白的突变子或编码其的核酸；该Cas12f1蛋白的突变子具有D143R//T147R//T203R//E206R中一种或多种突变；该Cas12f1蛋白其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。通过对Cas12f1蛋白的突变编辑效率较野生型平均提高了近5倍，之后通过在编辑系统的N端融合Sso7d，其编辑效率相较于野生型进一步提高至约10倍。该碱基编辑器系统还包括缩短的sgRNA，长度相较于原始版本缩短了一半，仅有96个核苷酸，不仅维持原有的ABE碱基编辑效率的同时又对编辑效率稍有增强。本发明的碱基编辑器系统可实现通过AAV，LNP等手段递送进行遗传疾病基因治疗。