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Velo-Predictor: An Ensemble Learning Pipeline for RNA Velocity Prediction | |
2021-01-28 | |
会议录名称 | THE 19TH ASIA PACIFIC BIOINFORMATICS CONFERENCE |
发表状态 | 正式接收 |
DOI | SUPP-D-20-00511 |
摘要 | Background: RNA velocity is a novel and powerful concept which enables the inference of dynamical cell state changes from seemingly static single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data. However, accurate estimation of RNA velocity is still a challenging problem, and the underlying kinetic mechanisms of transcriptional and splicing regulations are not fully clear. Moreover, scRNA-seq data tend to be sparse compared with possible cell states, and a given dataset of estimated RNA velocities needs imputation for some cell states not yet covered. |
会议录编者/会议主办者 | H. Sunny Sun |
关键词 | RNA velocity Single cell Ensemble learning Landscape |
收录类别 | SCI |
语种 | 英语 |
文献类型 | 会议论文 |
条目标识符 | https://kms.shanghaitech.edu.cn/handle/2MSLDSTB/126756 |
专题 | 信息科学与技术学院_硕士生 信息科学与技术学院_PI研究组_郑杰组 |
通讯作者 | Zheng J(郑杰) |
作者单位 | 上海科技大学 |
第一作者单位 | 上海科技大学 |
通讯作者单位 | 上海科技大学 |
第一作者的第一单位 | 上海科技大学 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | Wang X,Zheng J. Velo-Predictor: An Ensemble Learning Pipeline for RNA Velocity Prediction[C]//H. Sunny Sun,2021. |
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文件名称/大小 | 文献类型 | 版本类型 | 开放类型 | 使用许可 |
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